ELFIS - Forst- und Holzwirtschaft

Titel (orig.): Nachweis und Quantifizierung von baumpathogenen Phytophthora-Arten der Polymerase-Kettenreaktion

Titel (engl.): Detection and quantification of Phytophthora species which are associated with root-rot diseases in European deciduous forests by species-specific polymerase chain reaction

Dokument-Autor(en): Schubert, R.
Bahnweg, G.
Nechwatal, J.
Jung, T.
Cooke, D.E.L.
Duncan, J.M.
Müller-Starck, G.
Langebartels, C.
Sandermann, H. Jr.
Oáwald, W.

Institution (Dokument): München Univ., Freising (Germany). Forstwissenschaftliche Fakultät. Sektion Forstgenetik

Quelle: European Journal of Forest Pathology
ISSN: 0300-1237
Germany, 1999, v. 29(3) p. 169-188, 8 ill., 2 tables. Bibliography 54 ref. Summaries (De, En, Fr), En
1. Kurzfassung: Es wurden artspezifische Oligonukleotidprimerpaare zum Nachweis von solchen Phytophthora-Arten entwickelt, die in europäischen Laubwäldern Wurzelfäule verursachen. Auf der Grundlage der transkribierten, internen Spacersequenzen der ribosomalen DNA-Repetitionseinheit ist das Primerpaar CITR1/CITR2 entwickelt worden, das ein 711 Basenpaare umfassendes, für Phytophthora citricola-DNA spezifisches PCR-Produkt liefert. Das Primerpaar CAMB3/CAMB4 liefert ein 1105 Basenpaare langes Amplifikat mit Phytophthora cambivora-DNA, und das Primerpaar QUERC1/QUERC2 erzeugt ein 842 Basenpaare umfassendes PCR-Produkt mit Phytophthora quercina-DNA. Beide PCR-Primerpaare wurden aus der DNA-Sequenz von artspezifischen RAPD-Fragmenten abgeleitet, welche mit Primern zufälliger Nukleotidfolge erzeugt worden sind. Die Artspezifität aller neu entwickelten PCR-Primerpaare wurde mit einer breiten Kollektion anderer Mikroorganismen getestet. Unter den beschriebenen Reaktionsbedingungen waren 100 pg (P. cambivora), 4 pg (P. quercina) bzw. 2 pg (P. citricola) genomische DNA ausreichend, um sichtbare Amplikate zu erhalten. Darüber hinaus konnten die betreffenden PCR-Produkte in künstlich infizierten Buchen- und Eichenkeimlingen am dritten Tag nach der Infektion mit Phytophthora cambivora, P. quercina und P. citricola nachgewiesen werden.

Publikationsjahr: 1999

Kommentar 1: Z 8*1804

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Titel (orig.):	Nachweis und Quantifizierung von baumpathogenen Phytophthora-Arten der Polymerase-Kettenreaktion
Titel (engl.):	Detection and quantification of Phytophthora species which are associated with root-rot diseases in European deciduous forests by species-specific polymerase chain reaction
Dokument-Autor(en):	Schubert, R. Bahnweg, G. Nechwatal, J. Jung, T. Cooke, D.E.L. Duncan, J.M. Müller-Starck, G. Langebartels, C. Sandermann, H. Jr. Oáwald, W.
Institution (Dokument):	München Univ., Freising (Germany). Forstwissenschaftliche Fakultät. Sektion Forstgenetik
Quelle:	European Journal of Forest Pathology ISSN: 0300-1237 Germany, 1999, v. 29(3) p. 169-188, 8 ill., 2 tables. Bibliography 54 ref. Summaries (De, En, Fr), En
1. Kurzfassung:	Es wurden artspezifische Oligonukleotidprimerpaare zum Nachweis von solchen Phytophthora-Arten entwickelt, die in europäischen Laubwäldern Wurzelfäule verursachen. Auf der Grundlage der transkribierten, internen Spacersequenzen der ribosomalen DNA-Repetitionseinheit ist das Primerpaar CITR1/CITR2 entwickelt worden, das ein 711 Basenpaare umfassendes, für Phytophthora citricola-DNA spezifisches PCR-Produkt liefert. Das Primerpaar CAMB3/CAMB4 liefert ein 1105 Basenpaare langes Amplifikat mit Phytophthora cambivora-DNA, und das Primerpaar QUERC1/QUERC2 erzeugt ein 842 Basenpaare umfassendes PCR-Produkt mit Phytophthora quercina-DNA. Beide PCR-Primerpaare wurden aus der DNA-Sequenz von artspezifischen RAPD-Fragmenten abgeleitet, welche mit Primern zufälliger Nukleotidfolge erzeugt worden sind. Die Artspezifität aller neu entwickelten PCR-Primerpaare wurde mit einer breiten Kollektion anderer Mikroorganismen getestet. Unter den beschriebenen Reaktionsbedingungen waren 100 pg (P. cambivora), 4 pg (P. quercina) bzw. 2 pg (P. citricola) genomische DNA ausreichend, um sichtbare Amplikate zu erhalten. Darüber hinaus konnten die betreffenden PCR-Produkte in künstlich infizierten Buchen- und Eichenkeimlingen am dritten Tag nach der Infektion mit Phytophthora cambivora, P. quercina und P. citricola nachgewiesen werden.
Publikationsjahr:	1999
Kommentar 1:	Z 8*1804